Oncobox-Combo-exome161: программный модуль для составления персонифицированного рейтинга противораковых препаратов при онкозаболеваниях на основе транскриптомных данных, а также для определения мутаций, транслокаций и числа копий для генов, включенных в панель экзомного секвенирования AmpliSeq foPythonIllumina Comprehensive Panel v3
Программа предназначена для составления персонифицированного рейтинга 160 таргетных противораковых препаратов, в том числе ингибиторов контрольных точек иммунитета, блокаторов тирозинкиназ, терапевтических моноклональных антител, ингибиторов метаболизма микротрубочек, блокаторов ангиогенеза и других, а также для характеристики наличия мутаций, транслокаций, числа копий, а также мутационной нагруженности опухоли, для 161 гена, включенного в панель экзомного секвенирования AmpliSeq foPythonIllumina Comprehensive Panel v3. Входными данными является информация о нормализованном уровне экспрессии генов человека. Входная информация сравнивается с данными для панели нормальных тканей. Выходными данными является автоматизированный отчет, содержащий персонифицированный рейтинг 160 противораковых препаратов, рассчитанный на основе молекулярной информации для конкретного образца опухолевой ткани.
Язык программирования: Python
Свидетельство о регистрации ПО.