Oncobox Sample Storage является RESTfull сервисом, для работы с ним подойдет любая программа, способная выполнять HTTP запросы (например, curl или Postman).
Sample Storage предназначено для хранения данных секвенирования и их аннотаций, приведенных к единому формату. Для сравнения и полноценного анализа нескольких образцов требуются дополнительные данные о пациенте, терапии и так далее. Часто они доступны только в неупорядоченном или неполном виде. Предварительное структурирование позволяет быстро отбирать для анализа требуемые образцы и сравнивать результаты друг с другом.
Основной сценарий использования:
Пользователь получает токен доступа используя свои учетные данные. Далее, с помощью полученного токена, выполняя запросы к сервису, пользователь извлекает данные для проводимого исследования. Oncobox Sample Storage хранит версионированные источники данных, что позволяет воспроизводить результаты исследований.
ПО может использоваться в:
- В научных исследованиях, где требуется анализ групп образцов. Например, при поиске новых молекулярных мишеней, исследовании эффективности препаратов, поиске клинико-патологических зависимостей.
- В медицинской деятельности для накопления данных о пациентах и последующего анализа транскриптомных изменений в опухоли для выбора наиболее эффективной терапии.